MySQL server through socket ‘/var/lib/mysql/mysql.sock
starting MySQL. ERROR! The server quit without updating PID file (/var/lib/mysql/tdd.domain.com.pid

Bu hataları alıyor iseniz

cd /var/lib/mysql
rm -rf ib_logfile0
rm -rf ib_logfile1
rm -rf ibdata1
service mysql restart

mysql onarmanız gerekebilir.

Onarma, analiz ve optimize işlemleri için gerekli komutlar aşağıda ki gibidir;

mysqlcheck --all-databases -r #repair
mysqlcheck --all-databases -a #analyze
mysqlcheck --all-databases -o #optimize